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Iberian Discussion Thread and News
#31
Dissertation presented at Uppsala University to be publicly examined in Ekmansalen,
Evolutionary Biology Centre, Norbyvägen 14, Uppsala, Friday, 3 March 2023 at 13:15 for
the degree of Doctor of Philosophy. The examination will be conducted in English. Faculty
examiner: Associate Professor Martin Sikora (University of Copenhagen (Globe Institute),
Denmark).
Abstract
Simões, L. G. 2023. Uncovering the Past through ancient DNA. The Fate and Legacy of the
last hunter-gatherers in Western Europe and Northwestern Africa. Digital Comprehensive
Summaries of Uppsala Dissertations from the Faculty of Science and Technology 2228. 65 pp.
Uppsala: Acta Universitatis Upsaliensis. ISBN 978-91-513-1684-0.

The genetic analysis of ancient human remains has revolutionized the study of human history,
opening a direct window onto the demographic and evolutionary events that shaped our species'
past. I use state-of-the-art ancient DNA methodologies, from sample collection and DNA
extraction to data analysis, to study the ancient past of the western Mediterranean region, where
climate does not favour DNA preservation. After the Last Glacial Maximum, amenable climatic
conditions enabled the development of agriculture in the Levant, initiating the Neolithic period.
In Europe, the transition from foraging to farming was driven by the migration of people from
Anatolia, but in North Africa, evidence indicates a cultural diffusion, instead of population
replacement. In this thesis, I show that this transition was in fact ignited by the migration of
early farmers from Iberia. Moreover, a different migration wave, originating in the Levant and
expanding within Africa, was associated with pastoralism in that region during the Neolithic.
While the Neolithic transition is one of the most studied periods of pre-history, earlier periods
are comparatively under-studied. Using whole genome sequencing data for 36 hunter-gatherers
from Iberia and France, I observed that genetic lineages rooted in the Palaeolithic, survived
throught the Mesolithic. Mesolithic hunter-gatherer populations formed social units that were
not based on familial bonds; exchanges between groups avoided consanguinity. Coexistence
with the first farming communities resulted in unidirectional admixture patterns, as we do not
find gene flow from farmers to the last hunter-gatherers. Finally, using a multidisciplinary
approach to study an exceptional individual of African descent buried in a Mesolithic shell
midden, we find that the burial of this man during the transatlantic slave trade period could
be an example of the maintenance of African cultural practices by African people displaced to
Europe. My thesis highlights the power of ancient DNA analysis to uncover events and patterns
of the human evolutionary history, but also that integrative approaches, where different lines of
evidence are combined, can lead to exciting findings.
Keywords: human evolution, archaeogenomics, ancient DNA, population genetics, huntergatherer
Luciana G. Simões, Department of Organismal Biology, Human Evolution, Norbyvägen 18 A,
Uppsala University, SE-752 36 Uppsala, Sweden.
© Luciana G. Simões 2023
ISSN 1651-6214
ISBN 978-91-513-1684-0
URN urn:nbnConfusede:uu:diva-493382 (http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:uu:diva-493382)
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FTDNA:
Revised Cambridge Reference Sequence
HVR1  CRS  16298 T C
HVR2  CRS 72 T  C 195 T C 263 A  315.1 C

R1b>DF27>Z195>Z98>R-S14445>R-Y493419>R-Z29704>R-S11121+

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#32
(11-30-2023, 08:53 PM)Sailgios Wrote: The new samples seem to be from sites near La Hoya, where our Celtiberian samples were collected from, but many of these individuals seem to be heavier in WHG and Steppe-related ancestry than them, judging by the PCA anyway. On the other hand some published IA individuals seem to plot close, or with, modern non-Basque Iberians..I'm not sure why considering the dataset even includes North African samples which should theoretically pull modern Iberians towards them and away from IA ones. Maybe we haven't seen these yet in G25

[Image: otiw3al.png]


Edit: Yeah, they do kind of state this in the study. 10% might not seem much, but BA Iberia had 15-20% Yamnaya-related so an additional 10% is very significant.
Quote:population genetic analyses revealed a relatively homogeneous group of individuals, with an increase of approximately 10 % of steppe-related ancestry, relative to the preceding Middle and Late Bronze Age individuals in northern Spain. Compared to published Iron Age individuals from northern/eastern Spain, the newly analysed individuals from Las Eretas, Alto de la Cruz, and El Castejón yielded less evidence of Mediterranean-related ancestry.

Tienes el link del estudio? Se me olvidó preguntarte la otra vez jajaja
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23andMe: 55.5% European, 33.7% Indigenous American, 4.2% WANA, 3.4% SSA and 3.2% Unassigned
AncestryDNA: 57.27% Europe, 35.81% Indigenous Americas-Mexico, 3.46% MENA and 3.45% SSA
FamilyTreeDNA: 56.9% Europe, 33% Americas, 8.2% MENA, <2% Horn of Africa and <1% Eastern India
Living DNA: 63.3% West Iberia, 34.3% Native Americas and 2.3% Yorubaland
MyHeritage DNA: 60.8% Mesoamerican & Andean, 21% European, 14.9% MENA and 3.3% Nigerian

[1] "penalty= 0.001"
[1] "Ncycles= 1000"
[1] "distance%=2.1116"

        Jalisciense

Iberian EMA,50.2
Native American,34.6
Guanche,7.4
Levantine EBA,4.6
African,3.2
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#33
si te refieres al trabajo de Luka Papac sobre los neonatos enterrados intramuros al sur de Navarra, puedes descargar el pdf completo aqui
https://books.ub.uni-heidelberg.de//prop...pter/18012
esta muy detallado en los haplogrupos pero han cometido errores en los marcadores paternos, a pesar de todo, cualquiera de este foro es capaz de interpretar los marcadores R1b. Han publicado el raw data de 4 en otro estudio mas reciente pero solo hay un varon R1b-P312 con cobertura baja en el cromosoma Y, el resto son mujeres y, atencion, una tine un subcado J1c2 rarisimo que solo se ha encontrado en una catalana viva de Girona (comparte 2 marcadores mitocondriales extra, un nuevo subclado) y otro esta ausente en poblacion vasca. Segun los datos de Papac, la mitad de los linajes maternos de estos neonatos son poco frecuentes en poblacion vasca nativa o estan totalmente ausentes. Asi que ese bajon en componente mediterraneo podria estar relacionado con una aportacion celtica continental por lado materno, porque los clados paternos parecen los tipicos R1b_DF27 noribericos, almenos en las mejores muestras
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#34
(03-08-2024, 12:34 PM)miquirumba Wrote: si te refieres al trabajo de Luka Papac sobre los neonatos enterrados intramuros al sur de Navarra, puedes descargar el pdf completo aqui
https://books.ub.uni-heidelberg.de//prop...pter/18012
esta muy detallado en los haplogrupos pero han cometido errores en los marcadores paternos, a pesar de todo, cualquiera de este foro es capaz de interpretar los marcadores R1b. Han publicado el raw data de 4 en otro estudio mas reciente pero solo hay un varon R1b-P312 con cobertura baja en el cromosoma Y, el resto son mujeres y, atencion, una tine un subcado J1c2 rarisimo que solo se ha encontrado en una catalana viva de Girona (comparte 2 marcadores mitocondriales extra, un nuevo subclado) y otro esta ausente en poblacion vasca. Segun los datos de Papac, la mitad de los linajes maternos de estos neonatos son poco frecuentes en poblacion vasca nativa o estan totalmente ausentes. Asi que ese bajon en componente mediterraneo podria estar relacionado con una aportacion celtica continental por lado materno, porque los clados paternos parecen los tipicos R1b_DF27 noribericos, almenos en las mejores muestras

Va! Gracias, para darle una leída entonces.
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23andMe: 55.5% European, 33.7% Indigenous American, 4.2% WANA, 3.4% SSA and 3.2% Unassigned
AncestryDNA: 57.27% Europe, 35.81% Indigenous Americas-Mexico, 3.46% MENA and 3.45% SSA
FamilyTreeDNA: 56.9% Europe, 33% Americas, 8.2% MENA, <2% Horn of Africa and <1% Eastern India
Living DNA: 63.3% West Iberia, 34.3% Native Americas and 2.3% Yorubaland
MyHeritage DNA: 60.8% Mesoamerican & Andean, 21% European, 14.9% MENA and 3.3% Nigerian

[1] "penalty= 0.001"
[1] "Ncycles= 1000"
[1] "distance%=2.1116"

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Native American,34.6
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Levantine EBA,4.6
African,3.2
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#35
I just hope we got some Lusitani/West Iberia IA samples soon as possible, also some Iberian Jewsih would be nice
[Image: dsxBdyE.png]
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#36
(03-08-2024, 12:34 PM)miquirumba Wrote: si te refieres al trabajo de Luka Papac sobre los neonatos enterrados intramuros al sur de Navarra, puedes descargar el pdf completo aqui
https://books.ub.uni-heidelberg.de//prop...pter/18012
esta muy detallado en los haplogrupos pero han cometido errores en los marcadores paternos, a pesar de todo, cualquiera de este foro es capaz de interpretar los marcadores R1b. Han publicado el raw data de 4 en otro estudio mas reciente pero solo hay un varon R1b-P312 con cobertura baja en el cromosoma Y, el resto son mujeres y, atencion, una tine un subcado J1c2 rarisimo que solo se ha encontrado en una catalana viva de Girona (comparte 2 marcadores mitocondriales extra, un nuevo subclado) y otro esta ausente en poblacion vasca. Segun los datos de Papac, la mitad de los linajes maternos de estos neonatos son poco frecuentes en poblacion vasca nativa o estan totalmente ausentes. Asi que ese bajon en componente mediterraneo podria estar relacionado con una aportacion celtica continental por lado materno, porque los clados paternos parecen los tipicos R1b_DF27 noribericos, almenos en las mejores muestras

I agree the J1c2 could have been brought by the Celts, as it is more northern European in distribution; I am J1c2b and it is Irish in origin.
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#37
Hola a todos , soy nuevo en el foro y espero poder aprender
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#38
(03-13-2024, 01:25 PM)Vinitharya Wrote:
(03-08-2024, 12:34 PM)miquirumba Wrote: si te refieres al trabajo de Luka Papac sobre los neonatos enterrados intramuros al sur de Navarra, puedes descargar el pdf completo aqui
https://books.ub.uni-heidelberg.de//prop...pter/18012
esta muy detallado en los haplogrupos pero han cometido errores en los marcadores paternos, a pesar de todo, cualquiera de este foro es capaz de interpretar los marcadores R1b. Han publicado el raw data de 4 en otro estudio mas reciente pero solo hay un varon R1b-P312 con cobertura baja en el cromosoma Y, el resto son mujeres y, atencion, una tine un subcado J1c2 rarisimo que solo se ha encontrado en una catalana viva de Girona (comparte 2 marcadores mitocondriales extra, un nuevo subclado) y otro esta ausente en poblacion vasca. Segun los datos de Papac, la mitad de los linajes maternos de estos neonatos son poco frecuentes en poblacion vasca nativa o estan totalmente ausentes. Asi que ese bajon en componente mediterraneo podria estar relacionado con una aportacion celtica continental por lado materno, porque los clados paternos parecen los tipicos R1b_DF27 noribericos, almenos en las mejores muestras

I agree the J1c2 could have been brought by the Celts, as it is more northern European in distribution; I am J1c2b and it is Irish in origin.

there is an ancient LBK sample from France dated circa 7,000 y.a. Schw72-17 - Schwindratzheim  
we could said your mitoclade is so ancient as European Neolithic thanks to all new samples found in the Balkans and Danube Basin (all Early farmers profile) https://www.theytree.com/mttree/?h=J1c2+
There's an Early Iron Age catalan sample from Ampurias J1c2c2. however, it is not common to find J1c2 in ancient iberian samples. Maybe your maternal ancestors moved mainly northwards after LBK crisis. It`s a continental clade that might incame to iberia in several waves from Bronze Age to Goths
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#39
Aprovecho el post para hacer una pregunta algo boba pero que sepan que soy malo distinguiendo colores y es que según este paper las provincias de madrid y toledo son un mezcla del componente rojo ( que llamo asturoleones ) y el amarillo ( que llamo castilla ) pero a diferencia de cantabria no parecen ser 50 y 50% de ambas componentes y me pregunta si es posible saber si van mas lado rojo o amarillo y porque existe este otro mapa donde por ejemplo el componente rojo tienen mucho del componente morado ( al que llamo gallegoportugues ) y si los nombres que uso para los colores estan bien dichos
PD : Si es posible también me gustaría saber como modelar a los canarios si con mallorquines , leoneses , gallegos etc ...
https://www.nature.com/articles/s41467-0...281ca0b1aa
https://www.lavanguardia.com/files/conte...5fb07.jpeg
https://www.nature.com/articles/s41467-0...248a2ca440
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#40
(03-13-2024, 01:45 AM)Novos Baianos Wrote: I just hope we got some Lusitani/West Iberia IA samples soon as possible, also some Iberian Jewsih would be nice

I have a lot of pet theories for various ancient groups. My current thinking of the Lusitani is that they slowly drifted west from a starting point in the north-east messeta in beaker times, reaching the eastern fringes of western Iberia later in the bronze age. I don’t think the Lusitanian language descends  from in-situ development in western coastal Iberia since beaker times. I think there was a drift west across the bronze age. However I might be totally wrong. I’d like to see a discussion about the origins of the Lusitanians.
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#41
Who knows if the galaico-lusitanians were nota peri-celtic populations that migrated as part of a late bronze age urnfield expansion? I doubt their langueage was a beaker remnent.
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#42
(04-16-2024, 07:44 PM)Sephesakueu Wrote: Who knows if the galaico-lusitanians were nota peri-celtic populations that migrated as part of a late bronze age urnfield expansion? I doubt their langueage was a beaker remnent.

What I've gathered so far, correct me if I'm wrong. Ibero-Celtic and Lusitanian are different with the latter being non-Celtic, possibly peri-Celtic like you mention.

It seems to me that Ibero-Celtic or Hispano-Celtic, or at least its ancestral component was in or around the Proto-Celtic sphere, while Lusitanian was further removed. Whether or not that means a separate isolated Bell Beaker dialect or not I don't know. I suppose there could be too much semantics in what I'm saying, but anyway

From what I understand, Hispano-Celtic lacks the Germanic influence that seems to have occurred in the rest of Celtic that we're aware of, supposedly from contacts estimated around the LBA period. So this seems to me to indicate that whoever the people who were ancestral to Hispano-Celts lived outside of this loop. Perhaps on the western fringes of the Proto-Celtic sphere before moving into Iberia. 

Lusitanian being something further removed from this, perhaps an earlier or otherwise separate arrival.
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U152>Z56>Z43>Z46>Z48>Z44>CTS8949>FTC82256 Lindeman
M222...>DF105>ZZ87>S588>S7814 Toner 
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#43
I have read long time ago about ancient populations in currents Portugal and Galicia. Some researchers suspect this population conformed a preceltic susbtract whose could continue after celts arrived to Iberian Peninsula in IA. I think the question is there are divergency of opinions respect to if Galicia-Lusitania population could “keep save” of celtic occupation/migration into Iberia, or also celts also occupied these regions.

In Manofthehour post there are some keys for understand it.

In spanish:

He leído hace mucho tiempo sobre poblaciones antiguas en los actuales Portugal y Galicia. Algunos investigadores sospechan que esta población conformó un sustrato precéltico que pudo continuar después de la llegada de los celtas a la Península Ibérica en IA. Creo que la cuestión es que hay divergencia de opiniones con respecto a si la población de Galicia-Lusitania podría “salvarse” de la ocupación/migración celta a Iberia, o si los celtas también ocuparon estas regiones.

En el post de Manofthehour hay algunas claves para entenderlo.
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23andMe: 98.8% Spanish & Portuguese, 0.3% Ashkenazi Jewish, 0.9% Trace Ancestry (0.4% Coptic Egypcian, 0.3% Nigerian, 0.2% Bengali & Northeast Indian).

My Heritage: 91.5% Iberian, 3.6% Ashkenazi Jewish, 2.7% Middle East, 2.2% Irish Scottish and Welsh.

The truth doesn’t become more authentic because whole world agrees with it.RaMBaM

-M. De la Torre, converse of jew-
-D. de Castilla, converse of moor-
-M. de Navas, converse of moor-
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#44
(04-16-2024, 03:04 PM)HDG33 Wrote: Aprovecho el post para hacer una pregunta algo boba pero que sepan que soy malo distinguiendo colores y es que según este paper las provincias de madrid y toledo son un mezcla del componente rojo ( que llamo asturoleones ) y el amarillo ( que llamo castilla ) pero a diferencia de cantabria no parecen ser 50 y 50% de ambas componentes y me pregunta si es posible saber si van mas lado rojo o amarillo y porque existe este otro mapa donde por ejemplo el componente rojo tienen mucho del componente morado ( al que llamo gallegoportugues ) y si los nombres que uso para los colores estan bien dichos
PD : Si es posible también me gustaría saber como modelar a los canarios si con mallorquines , leoneses , gallegos etc ...
https://www.nature.com/articles/s41467-0...281ca0b1aa
https://www.lavanguardia.com/files/conte...5fb07.jpeg
https://www.nature.com/articles/s41467-0...248a2ca440

siempre he sido muy critico con ese estudio de Clare Brycroft et al. 2019 sobre los modelos genetico ibericos modernos. estuvimos comentando todo 2019 y 2020 las pocas muestras andaluzas que tomaron con respecto a las gallegas y la exclusion de Portugal sin sentido cuando es dificil entender realmente la genetica de la poblacion nativa iberica actual sin analizar al detalle las subpoblaciones lusas ( y por supuestos las insulares atlanticas y baleares). Se trata de un estudio muy sensacionalista que ha caido muy bajo despues que se descubriera que en Periodo Tardorromano se han encontrado varias muestras de ADN antigua en Turingia y Baviera que se parecen muchisimo a los ibericos nativos modernos, y las nuevas celtas del siglo II a.J.C halladas cerca de Verona, Italia, lo ponen todo patas arriba, porque parecen  catalanes actuales del Emporda. Sin Embargo, las muestras de nativos ibericos tardorromanos tiene perfiles muy diversos: lusos de MIroiço con un perfil parecido a los canarios actuales, godos con perfil celta, y mucho Mediterraneo Oriental con norafricano en todo el sur de Hispania.
Ese modelo vertical secundando los mapas de la Reconquista esata muy sesgado por un muestreo racano y poco cientifico. Con los cientos de muestras ibericas de ADN clasico y medieval que ya tenemos analizandolo en comparativa con los cientos de muestras de todas las regiones ibericas que son accesibles se podria hacer un modelo mucha mas realista y cientifico aunque dudo que gustara en resultados al publico en general porque mostraria grandes contrastes en muchas comunidades que no encanjan en la doctrina historicista de modelo iberico unico (excepto los vascos) que nos han inculcado
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#45
(04-16-2024, 09:52 PM)miquirumba Wrote:
(04-16-2024, 03:04 PM)HDG33 Wrote: Aprovecho el post para hacer una pregunta algo boba pero que sepan que soy malo distinguiendo colores y es que según este paper las provincias de madrid y toledo son un mezcla del componente rojo ( que llamo asturoleones ) y el amarillo ( que llamo castilla ) pero a diferencia de cantabria no parecen ser 50 y 50% de ambas componentes y me pregunta si es posible saber si van mas lado rojo o amarillo y porque existe este otro mapa donde por ejemplo el componente rojo tienen mucho del componente morado ( al que llamo gallegoportugues ) y si los nombres que uso para los colores estan bien dichos
PD : Si es posible también me gustaría saber como modelar a los canarios si con mallorquines , leoneses , gallegos etc ...
https://www.nature.com/articles/s41467-0...281ca0b1aa
https://www.lavanguardia.com/files/conte...5fb07.jpeg
https://www.nature.com/articles/s41467-0...248a2ca440

siempre he sido muy critico con ese estudio de Clare Brycroft et al. 2019 sobre los modelos genetico ibericos modernos. estuvimos comentando todo 2019 y 2020 las pocas muestras andaluzas que tomaron con respecto a las gallegas y la exclusion de Portugal sin sentido cuando es dificil entender realmente la genetica de la poblacion nativa iberica actual sin analizar al detalle las subpoblaciones lusas ( y por supuestos las insulares atlanticas y baleares). Se trata de un estudio muy sensacionalista que ha caido muy bajo despues que se descubriera que en Periodo Tardorromano se han encontrado varias muestras de ADN antigua en Turingia y Baviera que se parecen muchisimo a los ibericos nativos modernos, y las nuevas celtas del siglo II a.J.C halladas cerca de Verona, Italia, lo ponen todo patas arriba, porque parecen  catalanes actuales del Emporda. Sin Embargo, las muestras de nativos ibericos tardorromanos tiene perfiles muy diversos: lusos de MIroiço con un perfil parecido a los canarios actuales, godos con perfil celta, y mucho Mediterraneo Oriental con norafricano en todo el sur de Hispania.
Ese modelo vertical secundando los mapas de la Reconquista esata muy sesgado por un muestreo racano y poco cientifico. Con los cientos de muestras ibericas de ADN clasico y medieval que ya tenemos analizandolo en comparativa con los cientos de muestras de todas las regiones ibericas que son accesibles se podria hacer un modelo mucha mas realista y cientifico aunque dudo que gustara en resultados al publico en general porque mostraria grandes contrastes en muchas comunidades que no encanjan en la doctrina historicista de modelo iberico unico (excepto los vascos) que nos han inculcado

El problema de España es el de siempre, que se cae constantemente en los fundamentalismos ideológicos, llamados por la academia “esencialismos”. Y se pretende adaptar la genética a las teorías esencialistas de la que cada uno sea seguidor, y la verdad está mucho más allá y es muy compleja.
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23andMe: 98.8% Spanish & Portuguese, 0.3% Ashkenazi Jewish, 0.9% Trace Ancestry (0.4% Coptic Egypcian, 0.3% Nigerian, 0.2% Bengali & Northeast Indian).

My Heritage: 91.5% Iberian, 3.6% Ashkenazi Jewish, 2.7% Middle East, 2.2% Irish Scottish and Welsh.

The truth doesn’t become more authentic because whole world agrees with it.RaMBaM

-M. De la Torre, converse of jew-
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